弘治元年(公元1488年)，明朝封罕慎为忠顺王。年底，吐鲁番阿黑麻率兵东来，假意与罕慎联姻，在哈密城下，伺机杀罕慎。仍令牙兰驻守。哈密都指挥阿木郎等，率众复迁苦峪避难。然而，此时阿黑麻仍忌讳明朝，不敢称占领哈密，仍然遣使入贡，并请代领西域职贡。兵部尚书马文升提议，下敕要求阿黑麻归还王母及金印。玺书一下，阿黑麻大怒，意欲出兵靠近边塞。从将牙兰称吐鲁番已经惹怒很多，如果再进攻将不利，并提议退还城印求和，以求后进。阿黑麻最终同意，并归还。

弘治二年(公元1489年)，明廷命罕慎之弟奄克孛刺承袭都督同知。弘治四年(公元1491年)，由于明廷干预，阿黑麻被迫交还哈密王印、城池及居民五百余人。

弘治五年(公元1492年)，哈密有回回、哈刺灰、畏兀儿三种民族，兵部尚书马文升奏请“必须得元代遗孳袭封，以理国事”，诏封曲先安定王族人、故忠顺王脱脱侄孙陕巴为忠顺王，遣使护送，并让奄克孛刺、阿术郎辅佐。不久，吐鲁番索求陕巴犒赐不得，而阿术郎更派遣哈刺灰族，掠夺吐鲁番牛马，招致阿黑麻大怒，意欲再次进攻。

弘治六年(公元1493年)，吐鲁番阿黑麻再取哈密城，肢解阿木郎，绑架忠顺王陕巴回吐鲁番，掠走金印，仍令牙兰驻守。明廷中大学士丘浚对马文升说，哈密战争应当由马文升挂帅。马文升则认为西域地方对中国不构成大危害，应当施以绥靖之策。大臣也称明朝的威胁在北方瓦剌，而不应当让兵部尚书去西部指挥。于是，明廷派兵部侍郎张海、都督侯谦前往。恰逢阿黑麻派遣头目写亦满速儿等四十人进贡言和。

廷议中，通事王英建议，利用西域各部落离间阿黑麻，并隔绝通市，以离间他们。廷议派遣张海前往，如果吐鲁番归还陕巴，则给予贡市;否则的话扣留使者。然而，张海遣送赍玺书往责，却没有得到回报。于是，张海修葺嘉峪关，并逮捕哈密奸细，奏请戍边广西。

张海未等到命令就先返回京师，并称，哈密的存亡不会影响到中国。明孝宗大怒，称其无功，将张海与侯谦逮捕入狱并罢黜。马文升则称戍边哈密汉奸，并采用王英计策，关闭嘉峪关，使得西域商人均怨恨阿黑麻。然而，西域人因此反而跟从阿黑麻，使得阿黑麻率领大军占领哈密，并自称可汗，掠夺罕东郡等地。

弘治八年(公元1495年)正月，阿黑麻向西离去，留下牙兰与撒他儿率精锐二百，镇守哈密，牙兰精通军事。马文升听后，认为应当袭击并活捉牙兰;并召见肃州指挥杨翥，命其以罕东兵三千为前锋，明军三千后继，星夜兼程偷袭哈密。此举亦得到甘肃巡抚都御史许进支持。

马文升并派遣副总兵彭清，统锐卒由南山驰至罕东，即调罕东诸番兵。许进及总兵刘宁抵达肃州，在嘉峪关外驻军，并星夜前往。然而，牙兰得知后逃脱，但属下八百人均被逮捕，明军占领哈密。自此西域开始忌惮中国。

当时，阿黑麻正忙于与赤斤蒙古卫争夺，不敢进军哈密。在战胜赤斤蒙古后，于弘治九年(公元1496年)三月，阿黑麻亲自率兵攻占哈密，令撒他儿、奄克孛刺居守。撒他儿不敢镇守哈密，于是，在刺木城驻军。奄...